Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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