Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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