Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm29423-205ENSMUST00000189006 1138 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms