Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp40Q8BWR4 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp40Q8BWR4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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