Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms