Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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