Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ube2q1Q7TSS2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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