Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms