Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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