Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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