Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Acsf3Q3URE1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Acsf3Q3URE1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms