Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms