Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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