Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms