Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms