Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms