Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pitx2P97474 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms