Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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