Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms