Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms