Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms