Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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