Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ClgnP52194 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms