Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VdrP48281 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms