Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrprbP47758 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms