Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.3 ms