Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprkP35822 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprkP35822 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprkP35822 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprkP35822 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprkP35822 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprkP35822 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprkP35822 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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