Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxa2P31245 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms