Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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