Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprmP28828 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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