Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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