Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms