Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a2P20490 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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