Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P20040 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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P20040 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P20040 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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