Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18533 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18533 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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P18533 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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P18533 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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P18533 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18533 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms