Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cfap126-204ENSMUST00000129651 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms