Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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