Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atp8b5A3FIN4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atp8b5A3FIN4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms