Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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