Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Col5a3Q9JLI2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms