Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Trim39Q9ESN2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trim39Q9ESN2 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms