Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm18820-201ENSMUST00000217424 916 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12475-201ENSMUST00000119476 1389 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm7951-201ENSMUST00000171388 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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