Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms