Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx20Q9D2Y5 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms