Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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