Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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