Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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