Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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