Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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