Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39cQ8VE09 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ttc39cQ8VE09 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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